海关查验货柜不合格，就会进缉私科。缉私局是关区打击走私的职能管理部门。
海关实施查验时需要提取货样、化验，以进一步确定或者鉴别进出口货物的品名御激册、规格等属性的，海关依照《中华人民共和国海关对进出口货物实施化验鉴定的规定》等有关规定办理。
有下列情形之一的，海关可以对已查验货物进行复验：
（一）经初次查验未能查明货物的真实属性，需要对已查验货物的某些性状做进一步确认的；
（二）货物涉嫌走私违规，需要重新查验的；
（三）进出口货物收发货人对海关查验结论有异议，提出复验要求并经海关同意的；
（四）其他海关认为必要铅携的情形。
扩展资料
《中华人民共和国海关法》规定
第二条 中华人民共和国海关是国家的进出关境（以下简称进出境）监督管理机关。海关依照本法和其他有关法律、行政法规，监管进出境的运输工具、货物、行李物品、邮递物品和其他物品（以下简称进出境运输工具、货物、物品），征收关税和其他税、费，查缉走私，并编制海关统计和办理其他海关业务。
第三条 国务院设立海关总署，统一管理全国海关。国家在对外开放的口岸和海关监管业务集中的地点镇宏设立海关。海关的隶属关系，不受行政区划的限制。
参考资料来源：百度百科-中华人民共和国海关法
中国投资指南-中华人民共和国海关进出口货物查验管理办法
